RNA World (beta): A virtual screening pipeline for RNA World

After quite some work, only a few day ago, I successfully finished the local experiments and the compilation of a proper process / protocol documentation aiming at setting up a virtual screening pipeline within the RNA World framework.
One of the next steps will be the incorporation of the required new applications into our BOINC server infrastructure.
Of course, besides aiming at examining RNA-binding proteins, I am also (and in fact primarily) interested in using RNAs as target structures to find molecular binders that enhance/interfere with RNA functions.

Nach einigen Vorarbeiten konnte ich vor ein paar Tagen die lokalen Experimente und die zugehörige Prozessdokumentation für das Aufsetzen einer "virtual screening"-Pipeline im Rahmen von RNA World abschliessen.
Als nächstes steht nun u.a. die Einbindung der erforderlichen neuen Applikationen in unsere BOINC-Serverinfrastruktur an.
Selbstverständlich interessiere ich mich neben der Untersuchung RNA-bindender Proteine auch (und eigentlich in erster Linie) dafür, RNAs als Zielstrukturen einzusetzen, um daran bindende Moleküle zu identifizieren, welche die jeweilige RNA in ihrer Funktion beeinträchtigen.

Michael.

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